Если бывший собственник до сих пор сейчас зарегистрирован выписывайте его по суду. Никаких исковых сроков для этого не существует.
Через МФЦ подают документы на выписку/прописку, работник МФЦ отдает паспорта работникам миграционной службы, которые в свою очередь через несколько дней приносят обратно в МФЦ паспорта со штампами о снятии с регистрации или регистрации по месту жительства. Потом приходит заявитель и получает свой паспорт и выписку из домкниги (если такая предусмотрена в регионе)

Добрый день. Отрывной талон часто теряется. Факт наличия зарегистрированного при имеющейся информации, что он выписался, может быть. Для начала надо разобраться как он выписывался: перепропиской по другому адресу или непосредственно в мфц по месту прикрепления адреса комнаты. Ищите контакты с продавцом и выясняйте, если не получится, то суд.

Так он выписался через МФЦ или не желает выписываться? Данные действительно могут идти долго. Вы ждали 2 года? Выписать бывшего собственника вы сможете в любое время. При чем тут срок давности? Вам в суд

Несколько месяцев - да! Но не два года!

На Вашем месте я бы сделала следующее:
1. Отправила бы письменное уведомление с требованием о снятии с регистрационного учета бывшего собственника на адрес регистрации (он же Ваш и есть) заказным письмом.
2. Собираете пакет документов для подачи в суд : пишите исковое заявление, к нему ДКП, выписку из ЕГРН, ф9 (выписка из домой книги) по вашему адресу и это письмо, которое к Вам вернется. Оплачиваете госпошлину.
3. Обращаетесь в суд.
Про 3 мес. не слышала. По любому надо обращаться, хоть и прошло 2 года с момента покупки.
А когда Вы берете ф9 о зарегистрированных лицах-в ней есть бывший владелец?
У меня был случай, что человек одновременно был зарегистрирован по 2м адресам. Получилось, что не выписываясь с 1-го адреса, прописался на 2-м. По халатности работников то ли потеряли документы, то ли не внесли что-то в базу. Возможно, и Вас прежний выписан, но не внесено. Возьмите для начала справку о регистрации по вашему адресу.

Очень к месту выражение "Доверяй, но проверяй"
В остальном, коллеги описали выше последовательность действий

Для чего срок исковой давности 3 мес...? ) Для начала убедитесь, что прежний хозяин не выписан- возьмите выписку из домовой книги. а потом с ней к адвокату / юристу за составлением искового заявления. Оплатите пошлину и в суд. Далее по повестке.